PRISMA 系统综述筛选与审计工作台

面向系统综述、Meta 分析与证据整合项目的本地优先研究级工作台。支持多来源文献导入、保守去重、双人复核、质量评价、历史回溯、PRISMA 2020 导出和审计证据包。

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如果你需要的不只是“画一张 PRISMA 图”，而是一套能经得起复查的筛选流程，这个项目重点解决四件事：

• 数据默认留在本地浏览器，适合还不方便上传到云端的研究资料。
• 导入、去重、筛选、全文复核、质量评价和导出都有可追溯记录。
• 双人复核冲突、来源文件调整和误操作可以被发现、阻断或回滚。
• 最终不仅能导出图和结果表，还能导出适合复核、答辩和方法学附录的审计证据。

为什么选择这个工作台

系统综述真正难的不是最后的图，而是过程是否经得起复查：哪些文献进来了，哪些被去重，哪些被规则筛掉，全文阶段为什么排除，双人复核冲突如何解决，调整来源文件后能不能回到上一版。这个项目围绕这些真实问题设计，尽量让筛选过程留下可复核的证据，而不是只留下一个最终数字。

研究工作中的问题	这个工作台的处理方式
中文数据库、PubMed、Web of Science 等来源格式混杂	支持 CSV / TSV / RIS / ENW / BibTeX / RDF / TXT / NBIB，可混合导入
自动去重容易误删	分成硬重复和疑似重复，硬重复才自动移除，疑似重复交给人工复核
大文件导入时页面像是卡住	常用格式使用 Worker 增量解析，并记录导入阶段、字节进度和记录数
PRISMA 图里的数字难以追溯	V2.2 增加 AuditEvent 和 ScreeningDecision，计数可从审计数据重算
全文排除理由分散在表格或备注里	内置标准 exclusion reason taxonomy，并导出排除理由汇总
质量评价经常脱离筛选流程	纳入研究可以进入条目级质量评价表单，并导出质量评价表、证据表和 GRADE 摘要
双人复核冲突影响最终导出可信度	V2.5 已把筛选和质量评价分歧纳入 resolver workflow、agreement metrics 和 unresolved conflict gate
上传错文件或调整来源后很难回退	V2.5.1 已加入本地项目快照、历史恢复和来源文件增减记录
使用 AI 辅助时担心不可解释	AI 默认关闭；示例 AI 建议必须经过人工确认，并写入审计日志

适合谁

用户	适合的使用场景
医学、护理、公卫、管理学研究生	完成系统综述或 Meta 分析的文献筛选和 PRISMA 输出
医院、科研团队和课题组	在本地整理多来源数据库导出，保留筛选过程证据
循证医学和卫生政策研究者	需要保守去重、双人复核、质量评价和审计记录的项目
中文数据库使用者	处理 CNKI / 万方 / 维普 / PubMed / RIS / RDF 等真实导出问题
方法学或软件论文准备者	需要可复现测试、benchmark 和 audit-ready 输出的开源工具链

一眼看懂工作流

flowchart LR
  A["导入文献"] --> B["保守去重"]
  B --> C["配置筛选规则"]
  C --> D["标题/摘要筛选"]
  D --> E["全文复核"]
  E --> F["质量评价"]
  F --> G["PRISMA 与审计包导出"]

阶段	关键产物
导入	标准化文献记录、来源文件信息、导入事件
去重	硬重复移除列表、疑似重复候选列表、去重证据
规则筛选	标题/摘要阶段的纳入、排除和不确定记录
人工复核	全文阶段最终判断、排除理由、复核备注
质量评价	研究设计建议、工具族建议、条目级质量评价、证据等级基线
导出	PRISMA SVG、结果表、筛选报告、审计包、质量评价表、证据表、GRADE 摘要、双审冲突证据

当前版本状态

版本线	路径	状态
V2.5 dual-review closeout	literature-screening-v2.2/	当前公开版本线。把双人全文复核和质量评价分歧纳入 reviewer isolation、conflict queue、resolver workflow、agreement metrics、冲突证据导出和 unresolved conflict gate；页面 shell、项目快照版本和 manifest 默认版本已统一到 V2.5。
V2.5.1 project history rollback	literature-screening-v2.2/	已完成。增加本地历史快照、版本恢复、来源文件增减后的可恢复状态，并在导入、筛选重跑、全文复核完成、质量保存、冲突解决和导出前生成恢复点。
V2.4 quality appraisal	literature-screening-v2.2/	已完成稳定能力。保留 V2.3 的 PRISMA-trAIce 透明审计能力，并加入质量评价模板、条目级质量表单、quality_appraisal.csv、evidence_table.csv 和 grade_summary.csv。真实 AI provider 仍不默认接入，v2.2 目录继续作为兼容发布路径。
V2.3 PRISMA-trAIce readiness	literature-screening-v2.2/	已完成 AI 使用登记、provider 边界、AI 建议日志、人工确认闭环和透明报告；不默认发送真实 AI 请求。
V2.2 audit-ready	literature-screening-v2.2/	已完成审计基础层，包括审计模型、工作流事件和审计包导出
V2.1 stable	literature-screening-v2.0/	历史稳定路径，保留 6 步工作流和早期质量评价入口
v1.7.x	根目录旧入口	历史维护版本，保留早期 PRISMA 工具能力

V2.5 closeout 的重点是让双人复核从“可用入口”变成可审计、可阻断风险的正式流程。V2.5 已作为当前公开版本线保留在同一个 literature-screening-v2.2/ 兼容路径中，并保持真实 AI provider 默认禁用。V2.5.1 已补上本地历史记录和回溯，避免用户上传错文件、调整来源或想回看上一版筛选结果时只能重来。当前重点导出包括：

文件	用途
project_manifest.json	项目基本信息、PRISMA 版本、AI 模式、设置
events.jsonl	导入、去重、筛选、复核、质量评价和导出的事件日志
screening_decisions.csv	可持久化的筛选决策表
exclusion_reasons.csv	排除理由 taxonomy 和计数
prisma_counts.json	从决策和事件重算的 PRISMA 计数
audit_summary.md	可读的审计摘要和注意事项
ai_usage_registry.json	AI 模式、provider 边界、允许阶段和用户确认记录
ai_suggestions.jsonl	AI 建议、hash、人工复核动作、关联 decision、review trace 字段和 PRISMA 计数边界
PRISMA_TRAICE_REPORT.md	No-AI 或 assistive-AI 透明报告，用于 PRISMA-trAIce readiness
quality_appraisal.csv	逐研究、逐领域的质量评价记录，包含人工填写的 judgement、支持性原文 / 页码、审稿备注和总体判断
evidence_table.csv	面向证据整理的 PICOS、效果量、质量判断和证据等级表
grade_summary.csv	按结局和 PICOS 分组的 GRADE 摘要脚手架，最终 certainty 和降级理由保留人工确认
dual_review_conflicts.csv	V2.5 双审冲突证据，包含筛选和质量评价分歧、A/B 审稿值、resolver/final 值和状态
dual_review_agreement.json	V2.5 一致性指标，包含配对决策、percent agreement、Cohen’s kappa 和冲突门禁状态

核心能力

能力	当前状态
多格式文献导入	支持 CSV / TSV / RIS / ENW / BibTeX / RDF / TXT / NBIB
常用格式增量解析	CSV / TSV / RIS / NBIB / ENW 走 Worker 分块解析
保守去重	硬重复自动移除，疑似重复进入人工复核
规则筛选	支持语言、年份、关键词、标题、作者、期刊等条件
全文复核	支持快捷键、排除理由、备注和单篇翻译入口
双人复核	V2.5 closeout 已支持 A/B 决策隔离、冲突队列、resolver workflow、agreement metrics 和 unresolved conflict gate
历史记录回溯	V2.5.1 已支持本地项目快照、版本恢复、来源文件增减记录，以及关键流程节点的恢复点
质量评价	V2.4 已支持模板族、条目级质量表单、人工 judgement、支持性原文 / 页码和审稿备注；V2.5 增加质量评价分歧处理
证据整理	已支持 quality_appraisal.csv、evidence_table.csv 和 grade_summary.csv
PRISMA 2020 导出	支持多主题 SVG、纳入/排除表和筛选报告
审计导出	已支持 manifest、event log、decision ledger、counts、summary、质量评价 audit trace 和双审冲突 gate event
PRISMA-trAIce readiness	已加入 AI mode、AI usage registry、mock suggestion log、人工复核 trace 字段和透明报告；当前不接真实 AI provider

性能与基准

操作	数据量	结果	说明
IndexedDB 写入	30,000 条	约 3-5s	500 条一批写入
分页查询	100 条	约 213ms	使用索引查询
虚拟列表渲染	30,000 条	约 16ms/帧	只渲染可见区域
自动删除精确率	benchmark	1.000	保守策略下避免误删
综合 Candidate F1	benchmark	0.957	疑似重复候选输出更稳定

基准数据来自 docs/benchmarks/dedup/post-implementation-benchmark-report.md。不同设备上的导入速度会有差异，README 中只保留已经有仓库证据支撑的数字。

技术架构

workspace.html              -> 工作台页面与步骤结构
app.js                      -> 主流程、规则筛选、复核、导出和状态管理
audit-engine.js             -> 审计模型、PRISMA-trAIce 数据结构、决策序列化和审计包构建
dual-review-engine.js       -> V2.5 双人复核冲突、resolver、agreement metrics 和导出逻辑
project-history-engine.js   -> V2.5.1 本地历史快照、状态克隆和回溯元数据
db-worker.js                -> IndexedDB 数据层
parser-worker.js            -> 多格式解析和后台消息编排
streaming-parser.js         -> 常用格式增量解析状态机
quality-engine.js           -> 质量评价模板、研究设计、证据等级、evidence table 和 GRADE summary
import-job-runtime.js       -> 导入任务阶段、进度和项目状态
dedup-engine.js             -> 保守去重引擎
virtual-list.js             -> 大规模列表渲染

测试

当前回归入口：

node tests\run-all-regressions.js

当前覆盖范围包括：

• audit model、workflow hooks、audit package export
• AI suggestion panel、human review flow、PRISMA-trAIce report、AI suggestion JSONL trace fields
• dual-review conflict queue、resolver workflow、agreement metrics、unresolved conflict gate
• project history snapshots、rollback flow、source-file add/remove recovery
• dedup engine、candidate duplicate export、benchmark smoke/regression
• import job state、parser chunk boundaries、import hardening
• quality engine、study-design classifier、quality appraisal CSV、evidence table、GRADE summary

最近一次 V2.5.1 回归结果：133/133 通过。

路线图

阶段	目标
V2.2	审计基础层、事件日志、可重算 PRISMA counts、审计包导出
V2.3	PRISMA-trAIce 数据模型、AI usage registry、AI suggestion log、透明报告
V2.4	已完成：质量评价模板、条目级质量表单、evidence table、GRADE summary
V2.5	当前公开版本线：双人复核隔离、冲突队列、resolver workflow、agreement metrics、unresolved conflict gate
V2.5.1	已完成：本地历史记录、项目快照、来源文件增减回溯、关键流程恢复点
V2.6	Conservative AI screening、ranking、prompt registry、provider abstraction
V3.0	landing page、demo dataset、benchmark、paper skeleton、发布材料

版本历史

V2.5.1 project history rollback（已完成，2026-06）

• 新增 project-history-engine.js，用于创建有界本地项目历史快照
• 新增历史记录面板和恢复入口，支持恢复到较早筛选状态
• 在 before_import、after_import、screening_rerun、fulltext_finalized、quality_saved、conflict_resolved 和 before_export 等节点生成恢复点
• 新增来源文件 add/remove 历史，移除来源文件前自动保留可恢复状态
• 恢复旧快照时保留当前完整历史时间线，避免回滚后丢失后续恢复点
• 为缺少稳定标识的记录保留 fallback audit id，避免来源文件移除后误删幸存记录的决策、AI 建议或质量评价状态
• 示例数据加载会写入 _source 和 _sourceFile，来源文件移除同样适用于内置示例数据
• 完整回归 133/133 通过

V2.5 dual-review closeout（当前公开版本线，2026-06）

• Reviewer A/B full-text decisions are isolated as durable ScreeningDecision records
• Screening conflicts generate a conflict queue across include / exclude / uncertain disagreements
• Resolver actions write final human decisions and review_conflict_resolved audit events
• Quality conflicts are detected across overall judgement, status, and domain judgements
• Quality resolver actions write final quality values and quality_conflict_resolved audit events
• Added dual_review_conflicts.csv and dual_review_agreement.json
• Final result exports are blocked while unresolved dual-review conflicts remain; conflict evidence exports remain available
• V2.5 closeout regression passed 121/121; headless Chrome smoke passed with 0 console errors and 0 runtime exceptions

V2.4 quality appraisal（已完成稳定能力，2026-05）

• 保留 literature-screening-v2.2/ 作为兼容发布路径
• 新增质量评价模板 schema，覆盖 RCT、cohort、case-control、cross-sectional、diagnostic accuracy 和 systematic review
• 新增 reviewer-editable item-level quality forms，支持领域判断、支持性原文 / 页码、审稿备注、总体判断、评价状态和评价备注
• 新增 quality_appraisal.csv
• 新增 evidence_table.csv
• 新增 grade_summary.csv，最终 GRADE certainty 和 downgrade reasons 仍由人工确认
• 质量评价修改写入 quality_appraisal_updated audit event，保留 before / after
• 不默认连接真实 AI provider，不保存或导出 API key
• 完整回归 115/115 通过

V2.3 PRISMA-trAIce readiness（已完成，2026-05）

• 新增 off、assistive、experimental AI mode
• 新增 provider abstraction，为未来 OpenAI-compatible endpoint 做边界准备，但默认禁用真实请求
• 导出 ai_usage_registry.json
• 导出 ai_suggestions.jsonl，包含 human action、linked decision、reviewed_at、human edit fields 和 prisma_count_boundary
• 导出 PRISMA_TRAICE_REPORT.md，支持 No-AI 和 assistive-AI 透明说明
• mock AI suggestion 只有在人工 accept/edit 后才会形成 ScreeningDecision
• rejected suggestion 不进入 PRISMA counts
• 不发送真实 AI provider 请求，不导出 API key 材料
• release-readiness gate 见 docs/checklists/V2.3_PRISMA_TRAICE_READINESS_CHECKLIST.md

V2.2 audit-ready (completed foundation, 2026-04)

• 新增 literature-screening-v2.2/ 独立工作区
• 新增 audit-engine.js
• 新增 ProjectManifest、AuditEvent、ScreeningDecision
• 导入、去重、规则筛选、全文复核、质量评价和导出节点写入审计事件
• 审计事件类型规范化：自动映射旧名称到 AUDIT_LEDGER_DESIGN.md 设计文档标准名称，保证旧数据兼容
• 审计导出采用稳定的 snake_case 字段命名（project_id、screening_stage、human_decision 等）
• 新增审计包导出：manifest、events、decisions、exclusion reasons、counts、summary
• AI 模式默认保持 off

V2.1 stable（历史 GitHub Pages 路径，2026-04）

• 工作流升级为 6 步，新增质量评价 / 证据等级步骤
• 常用格式 CSV / TSV / RIS / NBIB / ENW 改为 Worker 增量解析
• 新增 quality-engine.js、import-job-runtime.js、streaming-parser.js
• 导入任务状态支持项目级持久化与阶段化显示
• 保留 literature-screening-v2.0/ 访问路径以兼容既有链接

V2.0（上一代主版本，2026-03）

• 新增独立首页 / 登录页 / 工作台结构
• 新增独立 dedup-engine.js 去重引擎
• 去重改为“硬重复自动移除 + 疑似重复人工复核”
• 修复 CSV / TSV 跨行摘要解析
• 全文复核弹窗新增单篇翻译入口
• 修复上传展示、页面滚动、步骤衔接和双人复核共享状态问题

v1.7.x（稳定维护版，2026-03）

• 补全 PubMed .nbib 导入支持
• 修复单人 / 双人模式 session 接线问题
• 修复去重后无法继续进入后续步骤的问题

参与贡献

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