NSCCN/YMP：面向大规模 NGS reads 数据处理的工作流框架，内置质控、剪切、污染去除、宏基因组组装、注释和 RNA-seq 转录本组装定量等流程。

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Elmar Pruesse

tests: fix actions/upload-artifact@v1 removed

6个月前1955次提交

.circleciChange channel order (cf>bc>default)7年前
.githubtests: fix actions/upload-artifact@v1 removed6个月前
docMerge branch 'master' into development4年前
srcfeat(config): also show resource_limits and overrides as props11个月前
testsfeat(yaml): add !clear tag to clear lists11个月前
.banditAdd bandit config9年前
.gitignoreUpdate gitignore (moved pkg root)8年前
.gitmodulesMerge branch 'trigger-nightly' of github.com:epruesse/ymp into development8年前
.readthedocs.ymlremove pinned env7年前
CHANGELOG.rstAdd changelog8年前
LICENSECreate LICENSE8年前
MANIFEST.inUpdate MANIFEST.in5年前
README.rstfix typo5年前
codecov.ymlTry fixing codecov not recognizing path src/ymp5年前
environment.yamlchore: update environment.yaml12个月前
fastentrypoints.pyCleanup fastentrypoints code8年前
pyproject.tomlTry fixing pytest-cov5年前
setup.cfgFix coverage source location5年前
setup.pyUpdate workflow and setup.py1年前

关于

面向大规模 NGS reads 数据处理的工作流框架，内置质控、剪切、污染去除、宏基因组组装、注释和 RNA-seq 转录本组装定量等流程。

工作流 NGS 质控宏基因组组装 RNA-seq 流程扩展生物医药健康 python r

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